Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRP54P61011 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP54P61011 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP54P61011 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP54P61011 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP54P61011 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP54P61011 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP54P61011 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP54P61011 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP54P61011 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP54P61011 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP54P61011 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP54P61011 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP54P61011 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP54P61011 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP54P61011 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP54P61011 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP54P61011 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP54P61011 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP54P61011 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP54P61011 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP54P61011 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP54P61011 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP54P61011 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP54P61011 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP54P61011 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SRP54P61011 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SRP54P61011 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP54P61011 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP54P61011 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP54P61011 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP54P61011 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP54P61011 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP54P61011 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP54P61011 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP54P61011 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP54P61011 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP54P61011 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP54P61011 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP54P61011 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP54P61011 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP54P61011 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP54P61011 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP54P61011 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP54P61011 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP54P61011 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP54P61011 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP54P61011 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP54P61011 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP54P61011 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP54P61011 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP54P61011 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRP54P61011 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SRP54P61011 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRP54P61011 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRP54P61011 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRP54P61011 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRP54P61011 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRP54P61011 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRP54P61011 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SRP54P61011 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRP54P61011 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRP54P61011 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRP54P61011 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRP54P61011 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRP54P61011 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRP54P61011 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRP54P61011 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRP54P61011 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRP54P61011 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRP54P61011 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRP54P61011 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRP54P61011 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRP54P61011 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRP54P61011 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRP54P61011 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRP54P61011 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRP54P61011 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SRP54P61011 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRP54P61011 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRP54P61011 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRP54P61011 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRP54P61011 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRP54P61011 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRP54P61011 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRP54P61011 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRP54P61011 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRP54P61011 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRP54P61011 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRP54P61011 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRP54P61011 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRP54P61011 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRP54P61011 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRP54P61011 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRP54P61011 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRP54P61011 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRP54P61011 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRP54P61011 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRP54P61011 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRP54P61011 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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