Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ERVFC1-1P60608 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1-1P60608 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms