Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GSDMDP57764 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSDMDP57764 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms