Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RIPPLY3P57055 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIPPLY3P57055 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms