Protein–RNA interactions for Protein: P56470

LGALS4, Galectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS4P56470 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LGALS4P56470 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms