Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPTEP56180 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPTEP56180 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPTEP56180 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPTEP56180 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TPTEP56180 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPTEP56180 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPTEP56180 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPTEP56180 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPTEP56180 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPTEP56180 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPTEP56180 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPTEP56180 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPTEP56180 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPTEP56180 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPTEP56180 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPTEP56180 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPTEP56180 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPTEP56180 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPTEP56180 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPTEP56180 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TPTEP56180 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TPTEP56180 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPTEP56180 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPTEP56180 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPTEP56180 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPTEP56180 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TPTEP56180 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TPTEP56180 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPTEP56180 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TPTEP56180 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPTEP56180 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPTEP56180 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPTEP56180 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPTEP56180 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPTEP56180 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPTEP56180 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPTEP56180 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPTEP56180 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPTEP56180 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPTEP56180 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPTEP56180 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPTEP56180 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPTEP56180 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TPTEP56180 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TPTEP56180 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TPTEP56180 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TPTEP56180 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TPTEP56180 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TPTEP56180 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TPTEP56180 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TPTEP56180 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TPTEP56180 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TPTEP56180 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TPTEP56180 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TPTEP56180 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TPTEP56180 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TPTEP56180 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TPTEP56180 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TPTEP56180 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TPTEP56180 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TPTEP56180 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TPTEP56180 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TPTEP56180 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TPTEP56180 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TPTEP56180 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TPTEP56180 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TPTEP56180 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TPTEP56180 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TPTEP56180 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TPTEP56180 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPTEP56180 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPTEP56180 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPTEP56180 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPTEP56180 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPTEP56180 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPTEP56180 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPTEP56180 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPTEP56180 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPTEP56180 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPTEP56180 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TPTEP56180 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPTEP56180 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPTEP56180 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPTEP56180 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPTEP56180 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPTEP56180 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPTEP56180 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPTEP56180 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPTEP56180 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPTEP56180 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPTEP56180 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPTEP56180 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TPTEP56180 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TPTEP56180 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPTEP56180 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPTEP56180 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPTEP56180 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPTEP56180 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPTEP56180 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms