Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN5P54829 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN5P54829 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN5P54829 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms