Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB3P54753 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB3P54753 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB3P54753 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB3P54753 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms