Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YARSP54577 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YARSP54577 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YARSP54577 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YARSP54577 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YARSP54577 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YARSP54577 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YARSP54577 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YARSP54577 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YARSP54577 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YARSP54577 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YARSP54577 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YARSP54577 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
YARSP54577 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YARSP54577 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YARSP54577 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YARSP54577 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YARSP54577 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YARSP54577 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YARSP54577 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YARSP54577 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YARSP54577 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YARSP54577 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YARSP54577 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YARSP54577 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YARSP54577 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YARSP54577 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
YARSP54577 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YARSP54577 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YARSP54577 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
YARSP54577 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YARSP54577 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YARSP54577 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YARSP54577 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YARSP54577 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YARSP54577 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YARSP54577 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YARSP54577 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
YARSP54577 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YARSP54577 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YARSP54577 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YARSP54577 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YARSP54577 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YARSP54577 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YARSP54577 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YARSP54577 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YARSP54577 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YARSP54577 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YARSP54577 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YARSP54577 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YARSP54577 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YARSP54577 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YARSP54577 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YARSP54577 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
YARSP54577 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YARSP54577 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YARSP54577 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YARSP54577 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YARSP54577 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YARSP54577 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YARSP54577 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YARSP54577 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YARSP54577 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YARSP54577 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YARSP54577 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
YARSP54577 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YARSP54577 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YARSP54577 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YARSP54577 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YARSP54577 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YARSP54577 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YARSP54577 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YARSP54577 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YARSP54577 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YARSP54577 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
YARSP54577 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
YARSP54577 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
YARSP54577 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
YARSP54577 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
YARSP54577 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
YARSP54577 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YARSP54577 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YARSP54577 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YARSP54577 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YARSP54577 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YARSP54577 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YARSP54577 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YARSP54577 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YARSP54577 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YARSP54577 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YARSP54577 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YARSP54577 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YARSP54577 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YARSP54577 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YARSP54577 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YARSP54577 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YARSP54577 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YARSP54577 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YARSP54577 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YARSP54577 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms