Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms