Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACLYP53396 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACLYP53396 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACLYP53396 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACLYP53396 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACLYP53396 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACLYP53396 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACLYP53396 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACLYP53396 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACLYP53396 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACLYP53396 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACLYP53396 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACLYP53396 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACLYP53396 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACLYP53396 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACLYP53396 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ACLYP53396 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACLYP53396 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACLYP53396 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ACLYP53396 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACLYP53396 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ACLYP53396 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACLYP53396 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACLYP53396 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ACLYP53396 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACLYP53396 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACLYP53396 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACLYP53396 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACLYP53396 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACLYP53396 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACLYP53396 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACLYP53396 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ACLYP53396 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ACLYP53396 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACLYP53396 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACLYP53396 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACLYP53396 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACLYP53396 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACLYP53396 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACLYP53396 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACLYP53396 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACLYP53396 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACLYP53396 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACLYP53396 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACLYP53396 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ACLYP53396 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACLYP53396 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ACLYP53396 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACLYP53396 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACLYP53396 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACLYP53396 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACLYP53396 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACLYP53396 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACLYP53396 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACLYP53396 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ACLYP53396 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACLYP53396 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACLYP53396 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACLYP53396 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACLYP53396 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACLYP53396 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACLYP53396 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACLYP53396 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACLYP53396 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACLYP53396 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACLYP53396 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACLYP53396 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ACLYP53396 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACLYP53396 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACLYP53396 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACLYP53396 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACLYP53396 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACLYP53396 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACLYP53396 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACLYP53396 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACLYP53396 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACLYP53396 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACLYP53396 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACLYP53396 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACLYP53396 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACLYP53396 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACLYP53396 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACLYP53396 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACLYP53396 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACLYP53396 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACLYP53396 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACLYP53396 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACLYP53396 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACLYP53396 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACLYP53396 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACLYP53396 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACLYP53396 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACLYP53396 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACLYP53396 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACLYP53396 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACLYP53396 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACLYP53396 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACLYP53396 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ACLYP53396 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACLYP53396 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms