Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKX2-5P52952 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKX2-5P52952 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms