Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDR1P51861 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDR1P51861 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDR1P51861 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDR1P51861 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDR1P51861 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDR1P51861 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDR1P51861 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDR1P51861 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDR1P51861 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDR1P51861 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDR1P51861 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDR1P51861 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDR1P51861 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDR1P51861 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDR1P51861 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDR1P51861 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDR1P51861 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDR1P51861 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDR1P51861 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDR1P51861 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDR1P51861 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDR1P51861 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDR1P51861 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDR1P51861 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDR1P51861 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDR1P51861 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDR1P51861 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDR1P51861 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDR1P51861 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDR1P51861 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDR1P51861 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDR1P51861 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDR1P51861 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDR1P51861 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDR1P51861 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDR1P51861 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDR1P51861 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDR1P51861 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDR1P51861 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDR1P51861 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDR1P51861 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDR1P51861 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDR1P51861 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDR1P51861 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDR1P51861 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDR1P51861 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR1P51861 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR1P51861 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR1P51861 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR1P51861 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR1P51861 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR1P51861 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR1P51861 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR1P51861 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR1P51861 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR1P51861 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR1P51861 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR1P51861 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR1P51861 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR1P51861 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDR1P51861 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDR1P51861 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDR1P51861 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDR1P51861 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDR1P51861 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDR1P51861 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDR1P51861 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDR1P51861 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDR1P51861 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDR1P51861 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDR1P51861 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDR1P51861 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDR1P51861 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDR1P51861 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDR1P51861 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDR1P51861 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDR1P51861 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDR1P51861 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDR1P51861 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDR1P51861 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDR1P51861 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDR1P51861 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDR1P51861 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDR1P51861 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR1P51861 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR1P51861 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR1P51861 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR1P51861 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR1P51861 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR1P51861 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR1P51861 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR1P51861 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR1P51861 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR1P51861 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR1P51861 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR1P51861 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR1P51861 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR1P51861 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDR1P51861 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms