Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR5P51681 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR5P51681 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR5P51681 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR5P51681 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR5P51681 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR5P51681 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR5P51681 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR5P51681 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR5P51681 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR5P51681 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR5P51681 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR5P51681 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR5P51681 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR5P51681 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR5P51681 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR5P51681 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR5P51681 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR5P51681 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR5P51681 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR5P51681 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR5P51681 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR5P51681 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR5P51681 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR5P51681 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR5P51681 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR5P51681 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR5P51681 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR5P51681 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR5P51681 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR5P51681 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR5P51681 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR5P51681 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR5P51681 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR5P51681 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR5P51681 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR5P51681 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR5P51681 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR5P51681 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR5P51681 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR5P51681 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR5P51681 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR5P51681 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR5P51681 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR5P51681 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR5P51681 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR5P51681 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR5P51681 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR5P51681 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR5P51681 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR5P51681 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR5P51681 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR5P51681 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR5P51681 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR5P51681 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR5P51681 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR5P51681 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR5P51681 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR5P51681 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR5P51681 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR5P51681 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR5P51681 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCR5P51681 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR5P51681 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR5P51681 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR5P51681 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR5P51681 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR5P51681 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR5P51681 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR5P51681 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR5P51681 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR5P51681 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR5P51681 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR5P51681 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR5P51681 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR5P51681 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR5P51681 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR5P51681 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR5P51681 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCR5P51681 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCR5P51681 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR5P51681 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR5P51681 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCR5P51681 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR5P51681 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCR5P51681 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCR5P51681 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR5P51681 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCR5P51681 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCR5P51681 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR5P51681 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR5P51681 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR5P51681 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR5P51681 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR5P51681 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR5P51681 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR5P51681 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR5P51681 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR5P51681 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR5P51681 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms