Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IDH3AP50213 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms