Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RARRES1P49788 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms