Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA1P49639 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA1P49639 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms