Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPFP49454 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPFP49454 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPFP49454 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPFP49454 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPFP49454 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPFP49454 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPFP49454 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPFP49454 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPFP49454 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPFP49454 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPFP49454 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPFP49454 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPFP49454 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPFP49454 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPFP49454 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPFP49454 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPFP49454 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPFP49454 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPFP49454 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPFP49454 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPFP49454 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPFP49454 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPFP49454 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPFP49454 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPFP49454 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPFP49454 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPFP49454 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPFP49454 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPFP49454 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPFP49454 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPFP49454 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPFP49454 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPFP49454 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPFP49454 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPFP49454 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPFP49454 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPFP49454 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPFP49454 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPFP49454 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPFP49454 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPFP49454 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPFP49454 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPFP49454 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPFP49454 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPFP49454 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPFP49454 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPFP49454 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPFP49454 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPFP49454 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPFP49454 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPFP49454 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPFP49454 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPFP49454 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPFP49454 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPFP49454 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPFP49454 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPFP49454 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPFP49454 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPFP49454 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPFP49454 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPFP49454 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPFP49454 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPFP49454 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPFP49454 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPFP49454 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPFP49454 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPFP49454 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPFP49454 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPFP49454 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPFP49454 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPFP49454 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPFP49454 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPFP49454 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPFP49454 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPFP49454 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPFP49454 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPFP49454 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPFP49454 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPFP49454 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPFP49454 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPFP49454 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPFP49454 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPFP49454 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPFP49454 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPFP49454 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPFP49454 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPFP49454 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPFP49454 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPFP49454 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPFP49454 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPFP49454 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPFP49454 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPFP49454 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPFP49454 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPFP49454 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPFP49454 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPFP49454 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CENPFP49454 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CENPFP49454 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms