Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK8P49336 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK8P49336 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK8P49336 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK8P49336 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK8P49336 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK8P49336 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK8P49336 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK8P49336 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDK8P49336 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK8P49336 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK8P49336 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK8P49336 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK8P49336 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK8P49336 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK8P49336 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK8P49336 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK8P49336 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK8P49336 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDK8P49336 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK8P49336 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK8P49336 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK8P49336 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK8P49336 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK8P49336 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK8P49336 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK8P49336 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK8P49336 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK8P49336 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK8P49336 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK8P49336 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDK8P49336 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK8P49336 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK8P49336 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK8P49336 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK8P49336 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK8P49336 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK8P49336 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK8P49336 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDK8P49336 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK8P49336 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK8P49336 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK8P49336 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK8P49336 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK8P49336 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDK8P49336 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK8P49336 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK8P49336 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK8P49336 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK8P49336 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK8P49336 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK8P49336 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK8P49336 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK8P49336 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK8P49336 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK8P49336 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK8P49336 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK8P49336 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK8P49336 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK8P49336 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK8P49336 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK8P49336 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK8P49336 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK8P49336 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK8P49336 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK8P49336 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK8P49336 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK8P49336 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK8P49336 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK8P49336 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK8P49336 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK8P49336 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK8P49336 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK8P49336 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK8P49336 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK8P49336 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK8P49336 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK8P49336 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK8P49336 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK8P49336 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK8P49336 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK8P49336 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK8P49336 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK8P49336 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK8P49336 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK8P49336 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK8P49336 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK8P49336 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK8P49336 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK8P49336 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK8P49336 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK8P49336 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK8P49336 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK8P49336 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK8P49336 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK8P49336 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK8P49336 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK8P49336 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK8P49336 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK8P49336 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms