Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NESP48681 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NESP48681 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
NESP48681 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
NESP48681 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
NESP48681 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC39.15■■■■□ 3.86
NESP48681 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
NESP48681 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
NESP48681 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
NESP48681 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
NESP48681 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
NESP48681 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
NESP48681 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
NESP48681 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
NESP48681 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
NESP48681 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
NESP48681 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
NESP48681 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
NESP48681 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
NESP48681 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
NESP48681 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
NESP48681 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
NESP48681 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
NESP48681 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
NESP48681 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
NESP48681 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
NESP48681 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
NESP48681 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
NESP48681 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC39.11■■■■□ 3.85
NESP48681 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
NESP48681 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
NESP48681 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
NESP48681 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
NESP48681 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
NESP48681 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
NESP48681 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
NESP48681 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
NESP48681 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
NESP48681 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
NESP48681 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
NESP48681 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
NESP48681 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
NESP48681 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
NESP48681 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
NESP48681 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
NESP48681 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
NESP48681 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
NESP48681 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
NESP48681 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
NESP48681 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
NESP48681 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
NESP48681 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.84
NESP48681 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
NESP48681 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC39.07■■■■□ 3.84
NESP48681 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
NESP48681 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
NESP48681 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
NESP48681 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
NESP48681 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
NESP48681 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC39.05■■■■□ 3.84
NESP48681 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
NESP48681 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
NESP48681 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
NESP48681 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
NESP48681 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
NESP48681 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
NESP48681 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
NESP48681 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
NESP48681 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
NESP48681 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
NESP48681 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
NESP48681 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
NESP48681 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC39.03■■■■□ 3.84
NESP48681 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
NESP48681 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
NESP48681 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
NESP48681 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
NESP48681 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
NESP48681 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
NESP48681 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
NESP48681 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
NESP48681 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
NESP48681 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
NESP48681 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
NESP48681 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
NESP48681 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.83
NESP48681 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
NESP48681 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC39■■■■□ 3.83
NESP48681 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
NESP48681 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
NESP48681 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
NESP48681 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
NESP48681 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
NESP48681 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
NESP48681 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
NESP48681 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
NESP48681 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
NESP48681 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
NESP48681 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
NESP48681 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms