Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT5P48643 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT5P48643 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT5P48643 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT5P48643 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT5P48643 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT5P48643 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT5P48643 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT5P48643 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT5P48643 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT5P48643 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT5P48643 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCT5P48643 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT5P48643 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT5P48643 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT5P48643 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT5P48643 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT5P48643 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT5P48643 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT5P48643 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT5P48643 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT5P48643 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT5P48643 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT5P48643 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT5P48643 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT5P48643 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT5P48643 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT5P48643 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT5P48643 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT5P48643 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT5P48643 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT5P48643 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT5P48643 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT5P48643 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT5P48643 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT5P48643 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT5P48643 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT5P48643 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT5P48643 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT5P48643 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT5P48643 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT5P48643 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT5P48643 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT5P48643 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT5P48643 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT5P48643 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT5P48643 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT5P48643 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT5P48643 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT5P48643 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT5P48643 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT5P48643 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT5P48643 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT5P48643 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT5P48643 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT5P48643 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT5P48643 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT5P48643 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT5P48643 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT5P48643 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT5P48643 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT5P48643 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT5P48643 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT5P48643 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT5P48643 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT5P48643 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT5P48643 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT5P48643 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT5P48643 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT5P48643 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT5P48643 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT5P48643 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT5P48643 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT5P48643 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT5P48643 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT5P48643 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT5P48643 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT5P48643 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT5P48643 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT5P48643 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT5P48643 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT5P48643 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT5P48643 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCT5P48643 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCT5P48643 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCT5P48643 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCT5P48643 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCT5P48643 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT5P48643 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT5P48643 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT5P48643 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT5P48643 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT5P48643 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT5P48643 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT5P48643 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT5P48643 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT5P48643 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT5P48643 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT5P48643 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT5P48643 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms