Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GCLMP48507 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCLMP48507 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCLMP48507 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCLMP48507 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCLMP48507 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCLMP48507 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCLMP48507 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCLMP48507 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCLMP48507 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCLMP48507 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GCLMP48507 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCLMP48507 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCLMP48507 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCLMP48507 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCLMP48507 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GCLMP48507 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCLMP48507 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCLMP48507 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCLMP48507 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCLMP48507 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCLMP48507 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCLMP48507 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCLMP48507 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCLMP48507 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCLMP48507 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCLMP48507 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCLMP48507 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCLMP48507 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCLMP48507 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCLMP48507 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCLMP48507 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCLMP48507 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GCLMP48507 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCLMP48507 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCLMP48507 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GCLMP48507 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GCLMP48507 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GCLMP48507 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCLMP48507 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCLMP48507 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCLMP48507 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GCLMP48507 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GCLMP48507 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCLMP48507 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCLMP48507 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCLMP48507 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCLMP48507 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCLMP48507 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GCLMP48507 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCLMP48507 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCLMP48507 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GCLMP48507 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GCLMP48507 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GCLMP48507 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCLMP48507 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCLMP48507 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCLMP48507 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCLMP48507 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCLMP48507 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCLMP48507 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GCLMP48507 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCLMP48507 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCLMP48507 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCLMP48507 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCLMP48507 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCLMP48507 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCLMP48507 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCLMP48507 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCLMP48507 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCLMP48507 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCLMP48507 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCLMP48507 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCLMP48507 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCLMP48507 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCLMP48507 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCLMP48507 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCLMP48507 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCLMP48507 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCLMP48507 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCLMP48507 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCLMP48507 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GCLMP48507 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCLMP48507 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCLMP48507 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCLMP48507 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GCLMP48507 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCLMP48507 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCLMP48507 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCLMP48507 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCLMP48507 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCLMP48507 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCLMP48507 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCLMP48507 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCLMP48507 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
GCLMP48507 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLMP48507 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLMP48507 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLMP48507 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCLMP48507 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms