Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ME1P48163 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ME1P48163 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ME1P48163 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ME1P48163 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ME1P48163 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ME1P48163 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ME1P48163 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ME1P48163 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ME1P48163 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ME1P48163 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ME1P48163 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ME1P48163 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ME1P48163 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ME1P48163 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ME1P48163 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ME1P48163 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ME1P48163 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ME1P48163 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ME1P48163 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ME1P48163 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ME1P48163 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ME1P48163 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ME1P48163 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ME1P48163 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ME1P48163 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ME1P48163 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ME1P48163 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ME1P48163 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ME1P48163 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ME1P48163 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ME1P48163 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ME1P48163 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ME1P48163 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME1P48163 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME1P48163 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME1P48163 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME1P48163 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME1P48163 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME1P48163 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME1P48163 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ME1P48163 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME1P48163 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME1P48163 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME1P48163 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME1P48163 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME1P48163 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME1P48163 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ME1P48163 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ME1P48163 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ME1P48163 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ME1P48163 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ME1P48163 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ME1P48163 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ME1P48163 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ME1P48163 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ME1P48163 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ME1P48163 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ME1P48163 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ME1P48163 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ME1P48163 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ME1P48163 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ME1P48163 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ME1P48163 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ME1P48163 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ME1P48163 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ME1P48163 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ME1P48163 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ME1P48163 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ME1P48163 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ME1P48163 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ME1P48163 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ME1P48163 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ME1P48163 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ME1P48163 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ME1P48163 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ME1P48163 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ME1P48163 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ME1P48163 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ME1P48163 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ME1P48163 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ME1P48163 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ME1P48163 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ME1P48163 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ME1P48163 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ME1P48163 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ME1P48163 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ME1P48163 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ME1P48163 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ME1P48163 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ME1P48163 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ME1P48163 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ME1P48163 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ME1P48163 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ME1P48163 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ME1P48163 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ME1P48163 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ME1P48163 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ME1P48163 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ME1P48163 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms