Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNPDA1P46926 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms