Protein–RNA interactions for Protein: P46776

RPL27A, 60S ribosomal protein L27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27AP46776 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL27AP46776 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL27AP46776 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms