Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOP2P46087 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOP2P46087 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOP2P46087 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOP2P46087 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOP2P46087 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOP2P46087 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NOP2P46087 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NOP2P46087 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NOP2P46087 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NOP2P46087 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NOP2P46087 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NOP2P46087 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOP2P46087 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOP2P46087 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOP2P46087 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOP2P46087 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOP2P46087 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOP2P46087 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOP2P46087 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOP2P46087 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOP2P46087 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOP2P46087 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOP2P46087 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOP2P46087 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOP2P46087 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOP2P46087 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOP2P46087 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOP2P46087 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOP2P46087 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOP2P46087 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOP2P46087 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOP2P46087 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOP2P46087 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOP2P46087 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOP2P46087 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOP2P46087 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOP2P46087 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NOP2P46087 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOP2P46087 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOP2P46087 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOP2P46087 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOP2P46087 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NOP2P46087 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOP2P46087 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOP2P46087 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOP2P46087 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOP2P46087 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOP2P46087 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOP2P46087 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOP2P46087 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOP2P46087 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOP2P46087 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOP2P46087 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOP2P46087 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOP2P46087 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOP2P46087 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOP2P46087 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOP2P46087 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOP2P46087 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOP2P46087 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP2P46087 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP2P46087 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP2P46087 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP2P46087 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP2P46087 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP2P46087 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP2P46087 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP2P46087 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP2P46087 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP2P46087 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP2P46087 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP2P46087 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP2P46087 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP2P46087 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP2P46087 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP2P46087 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOP2P46087 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOP2P46087 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOP2P46087 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NOP2P46087 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOP2P46087 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOP2P46087 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOP2P46087 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOP2P46087 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOP2P46087 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOP2P46087 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOP2P46087 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOP2P46087 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOP2P46087 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOP2P46087 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOP2P46087 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOP2P46087 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOP2P46087 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOP2P46087 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOP2P46087 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOP2P46087 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOP2P46087 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOP2P46087 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NOP2P46087 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms