Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP13P45452 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP13P45452 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP13P45452 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP13P45452 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP13P45452 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP13P45452 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP13P45452 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP13P45452 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP13P45452 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP13P45452 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP13P45452 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP13P45452 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP13P45452 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP13P45452 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP13P45452 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP13P45452 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP13P45452 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP13P45452 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP13P45452 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP13P45452 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP13P45452 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP13P45452 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP13P45452 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MMP13P45452 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP13P45452 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP13P45452 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP13P45452 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP13P45452 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP13P45452 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP13P45452 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MMP13P45452 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP13P45452 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP13P45452 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MMP13P45452 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP13P45452 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP13P45452 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP13P45452 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP13P45452 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP13P45452 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP13P45452 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP13P45452 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP13P45452 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MMP13P45452 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP13P45452 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP13P45452 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP13P45452 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP13P45452 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP13P45452 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP13P45452 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP13P45452 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP13P45452 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP13P45452 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP13P45452 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP13P45452 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP13P45452 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP13P45452 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP13P45452 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MMP13P45452 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP13P45452 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP13P45452 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP13P45452 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP13P45452 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP13P45452 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP13P45452 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP13P45452 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP13P45452 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP13P45452 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP13P45452 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP13P45452 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MMP13P45452 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP13P45452 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP13P45452 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP13P45452 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP13P45452 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP13P45452 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP13P45452 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP13P45452 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MMP13P45452 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP13P45452 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP13P45452 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP13P45452 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP13P45452 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP13P45452 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP13P45452 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP13P45452 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP13P45452 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MMP13P45452 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP13P45452 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP13P45452 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP13P45452 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP13P45452 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP13P45452 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP13P45452 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP13P45452 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP13P45452 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP13P45452 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP13P45452 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP13P45452 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP13P45452 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms