Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRATP43155 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRATP43155 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRATP43155 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRATP43155 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRATP43155 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRATP43155 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRATP43155 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRATP43155 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRATP43155 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRATP43155 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRATP43155 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRATP43155 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRATP43155 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRATP43155 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRATP43155 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRATP43155 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRATP43155 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CRATP43155 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRATP43155 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRATP43155 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRATP43155 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRATP43155 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRATP43155 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRATP43155 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRATP43155 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRATP43155 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRATP43155 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRATP43155 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRATP43155 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRATP43155 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRATP43155 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRATP43155 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CRATP43155 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CRATP43155 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CRATP43155 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CRATP43155 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRATP43155 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRATP43155 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRATP43155 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRATP43155 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRATP43155 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRATP43155 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRATP43155 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRATP43155 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRATP43155 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRATP43155 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRATP43155 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRATP43155 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CRATP43155 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRATP43155 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRATP43155 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRATP43155 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRATP43155 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRATP43155 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRATP43155 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRATP43155 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRATP43155 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRATP43155 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRATP43155 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRATP43155 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRATP43155 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRATP43155 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRATP43155 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRATP43155 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRATP43155 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRATP43155 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRATP43155 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRATP43155 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRATP43155 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRATP43155 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRATP43155 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRATP43155 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRATP43155 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRATP43155 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRATP43155 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRATP43155 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRATP43155 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRATP43155 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRATP43155 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CRATP43155 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRATP43155 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRATP43155 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRATP43155 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRATP43155 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRATP43155 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRATP43155 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRATP43155 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRATP43155 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRATP43155 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRATP43155 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CRATP43155 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRATP43155 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRATP43155 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRATP43155 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRATP43155 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRATP43155 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRATP43155 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRATP43155 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRATP43155 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms