Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIK1P39086 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIK1P39086 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIK1P39086 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms