Protein–RNA interactions for Protein: P37023

ACVRL1, Serine/threonine-protein kinase receptor R3, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVRL1P37023 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACVRL1P37023 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVRL1P37023 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms