Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL4P36578 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL4P36578 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL4P36578 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL4P36578 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL4P36578 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL4P36578 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL4P36578 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL4P36578 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL4P36578 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL4P36578 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL4P36578 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL4P36578 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL4P36578 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL4P36578 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL4P36578 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL4P36578 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL4P36578 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL4P36578 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL4P36578 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL4P36578 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL4P36578 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL4P36578 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL4P36578 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL4P36578 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL4P36578 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL4P36578 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL4P36578 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL4P36578 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL4P36578 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL4P36578 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL4P36578 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL4P36578 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL4P36578 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL4P36578 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL4P36578 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL4P36578 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL4P36578 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL4P36578 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL4P36578 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL4P36578 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL4P36578 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL4P36578 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL4P36578 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL4P36578 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL4P36578 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL4P36578 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL4P36578 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL4P36578 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL4P36578 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL4P36578 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL4P36578 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL4P36578 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL4P36578 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL4P36578 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL4P36578 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL4P36578 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL4P36578 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL4P36578 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL4P36578 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL4P36578 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL4P36578 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL4P36578 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL4P36578 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL4P36578 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL4P36578 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL4P36578 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL4P36578 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL4P36578 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL4P36578 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL4P36578 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL4P36578 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL4P36578 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL4P36578 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL4P36578 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL4P36578 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL4P36578 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL4P36578 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL4P36578 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL4P36578 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL4P36578 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL4P36578 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL4P36578 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL4P36578 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL4P36578 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL4P36578 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL4P36578 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL4P36578 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL4P36578 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL4P36578 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL4P36578 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL4P36578 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL4P36578 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL4P36578 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL4P36578 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL4P36578 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL4P36578 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL4P36578 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL4P36578 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL4P36578 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms