Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA7P36544 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms