Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRIM23P36406 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM23P36406 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms