Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHKAP35790 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHKAP35790 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHKAP35790 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHKAP35790 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHKAP35790 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHKAP35790 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHKAP35790 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHKAP35790 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHKAP35790 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHKAP35790 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHKAP35790 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHKAP35790 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHKAP35790 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHKAP35790 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHKAP35790 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHKAP35790 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHKAP35790 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHKAP35790 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHKAP35790 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHKAP35790 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHKAP35790 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHKAP35790 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHKAP35790 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHKAP35790 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHKAP35790 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHKAP35790 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHKAP35790 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHKAP35790 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHKAP35790 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHKAP35790 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHKAP35790 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHKAP35790 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHKAP35790 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHKAP35790 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHKAP35790 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHKAP35790 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHKAP35790 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHKAP35790 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHKAP35790 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHKAP35790 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHKAP35790 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHKAP35790 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHKAP35790 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHKAP35790 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHKAP35790 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHKAP35790 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHKAP35790 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHKAP35790 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHKAP35790 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHKAP35790 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHKAP35790 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHKAP35790 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHKAP35790 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CHKAP35790 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHKAP35790 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHKAP35790 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHKAP35790 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHKAP35790 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHKAP35790 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHKAP35790 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHKAP35790 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHKAP35790 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHKAP35790 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHKAP35790 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHKAP35790 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHKAP35790 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHKAP35790 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHKAP35790 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHKAP35790 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHKAP35790 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHKAP35790 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHKAP35790 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHKAP35790 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHKAP35790 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHKAP35790 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHKAP35790 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHKAP35790 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHKAP35790 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHKAP35790 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHKAP35790 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHKAP35790 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHKAP35790 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHKAP35790 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHKAP35790 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHKAP35790 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHKAP35790 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHKAP35790 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHKAP35790 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHKAP35790 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHKAP35790 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHKAP35790 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHKAP35790 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHKAP35790 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHKAP35790 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHKAP35790 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHKAP35790 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHKAP35790 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHKAP35790 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHKAP35790 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms