Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SFTPDP35247 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFTPDP35247 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms