Protein–RNA interactions for Protein: P34220

YBL055C, Deoxyribonuclease Tat-D, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL055CP34220 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt4.6□□□□□ -1.67
YBL055CP34220 SFH5YJL145W 885 nt4.6□□□□□ -1.67
YBL055CP34220 YPL114WYPL114W 420 nt4.6□□□□□ -1.67
YBL055CP34220 YBR134WYBR134W 402 nt4.6□□□□□ -1.67
YBL055CP34220 GGA1YDR358W 1674 nt4.6□□□□□ -1.67
YBL055CP34220 YPL260WYPL260W 1656 nt4.6□□□□□ -1.67
YBL055CP34220 SKM1YOL113W 1968 nt4.6□□□□□ -1.67
YBL055CP34220 LAS21YJL062W 2493 nt4.6□□□□□ -1.67
YBL055CP34220 PTC1YDL006W 846 nt4.59□□□□□ -1.67
YBL055CP34220 PUS9YDL036C 1389 nt4.59□□□□□ -1.67
YBL055CP34220 COQ4YDR204W 1008 nt4.59□□□□□ -1.67
YBL055CP34220 CYM1YDR430C 2970 nt4.59□□□□□ -1.67
YBL055CP34220 ARC1YGL105W 1131 nt4.59□□□□□ -1.67
YBL055CP34220 ADH4YGL256W 1149 nt4.59□□□□□ -1.67
YBL055CP34220 CIR1YGR207C 786 nt4.59□□□□□ -1.67
YBL055CP34220 FAA3YIL009W 2085 nt4.59□□□□□ -1.67
YBL055CP34220 SNL1YIL016W 480 nt4.59□□□□□ -1.67
YBL055CP34220 HRT3YLR097C 1035 nt4.59□□□□□ -1.67
YBL055CP34220 ALG9YNL219C 1668 nt4.59□□□□□ -1.67
YBL055CP34220 IRC14YOR135C 342 nt4.59□□□□□ -1.67
YBL055CP34220 PDX3YBR035C 687 nt4.59□□□□□ -1.67
YBL055CP34220 KIC1YHR102W 3243 nt4.59□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 IPI3YNL182C 1668 nt4.58□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 KTR7YIL085C 1554 nt4.58□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 KCC4YCL024W 3114 nt4.58□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 GAS5YOL030W 1455 nt4.58□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 LAP3YNL239W 1365 nt4.58□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 CLB5YPR120C 1308 nt4.58□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 KIN28YDL108W 921 nt4.58□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt4.58□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 YJL220WYJL220W 453 nt4.58□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 SPO20YMR017W 1194 nt4.58□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 GPI12YMR281W 915 nt4.58□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 YNR042WYNR042W 429 nt4.58□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 OPY2YPR075C 1083 nt4.58□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 YGR266WYGR266W 2106 nt4.58□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 HUL4YJR036C 2679 nt4.58□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 MEF2YJL102W 2460 nt4.57□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 OCT1YKL134C 2319 nt4.57□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 STP4YDL048C 1473 nt4.57□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 STR2YJR130C 1920 nt4.57□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 YDR056CYDR056C 618 nt4.57□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 SPR6YER115C 576 nt4.57□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 BUD13YGL174W 801 nt4.57□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 CCS1YMR038C 750 nt4.57□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 TPP1YMR156C 717 nt4.57□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 GRC3YLL035W 1899 nt4.57□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 XKS1YGR194C 1803 nt4.57□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 HIS4YCL030C 2400 nt4.57□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 HRK1YOR267C 2280 nt4.57□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 HOYDL227C 1761 nt4.56□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt4.56□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 snR63snR63 255 nt4.56□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 SUR2YDR297W 1050 nt4.56□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 YGR016WYGR016W 573 nt4.56□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 WSS1YHR134W 810 nt4.56□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 LOH1YJL038C 660 nt4.56□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 YJL218WYJL218W 591 nt4.56□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 MRM1YOR201C 1239 nt4.56□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 PET20YPL159C 762 nt4.56□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 YEH2YLR020C 1617 nt4.56□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 FDC1YDR539W 1512 nt4.56□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.56□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 STB2YMR053C 2553 nt4.56□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 IME4YGL192W 1803 nt4.56□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 NUP42YDR192C 1293 nt4.55□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 YDR222WYDR222W 1248 nt4.55□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 RPB7YDR404C 516 nt4.55□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 YGL199CYGL199C 471 nt4.55□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 DAM1YGR113W 1032 nt4.55□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 VPS71YML041C 843 nt4.55□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 YMR010WYMR010W 1218 nt4.55□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 RGS2YOR107W 930 nt4.55□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 SUA7YPR086W 1038 nt4.55□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 ECM32YER176W 3366 nt4.55□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 YIL001WYIL001W 1542 nt4.55□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 PHO12YHR215W 1404 nt4.55□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 PHO11YAR071W 1404 nt4.55□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 RAD52YML032C 1416 nt4.55□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 MET12YPL023C 1974 nt4.54□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.54□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 CDC42YLR229C 576 nt4.54□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 RCL1YOL010W 1104 nt4.54□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 ICY2YPL250C 411 nt4.54□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 MNN4YKL201C 3537 nt4.54□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 MSE1YOL033W 1611 nt4.54□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 BUD8YLR353W 1812 nt4.53□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 PEX30YLR324W 1572 nt4.53□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 OCA4YCR095C 1089 nt4.53□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 YJR056CYJR056C 711 nt4.53□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 BLM10YFL007W 6432 nt4.53□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 YCR023CYCR023C 1836 nt4.53□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 IKS1YJL057C 2004 nt4.53□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 TOG1YER184C 2385 nt4.53□□□□□ -1.68
YBL055CP34220 PRP28YDR243C 1767 nt4.53□□□□□ -1.69
YBL055CP34220 UPC2YDR213W 2742 nt4.52□□□□□ -1.69
YBL055CP34220 PMT4YJR143C 2289 nt4.52□□□□□ -1.69
YBL055CP34220 YDR161WYDR161W 1164 nt4.52□□□□□ -1.69
YBL055CP34220 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt4.52□□□□□ -1.69
YBL055CP34220 YLR049CYLR049C 1287 nt4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17 ms