Protein–RNA interactions for Protein: P33991

MCM4, DNA replication licensing factor MCM4, humanhuman

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM4P33991 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCM4P33991 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCM4P33991 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCM4P33991 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCM4P33991 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCM4P33991 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCM4P33991 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCM4P33991 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCM4P33991 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCM4P33991 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM4P33991 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM4P33991 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM4P33991 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM4P33991 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM4P33991 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM4P33991 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM4P33991 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM4P33991 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM4P33991 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM4P33991 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM4P33991 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM4P33991 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCM4P33991 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCM4P33991 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCM4P33991 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCM4P33991 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MCM4P33991 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCM4P33991 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCM4P33991 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCM4P33991 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCM4P33991 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCM4P33991 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCM4P33991 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCM4P33991 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCM4P33991 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCM4P33991 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCM4P33991 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MCM4P33991 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
MCM4P33991 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MCM4P33991 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM4P33991 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM4P33991 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM4P33991 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM4P33991 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM4P33991 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM4P33991 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM4P33991 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM4P33991 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM4P33991 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM4P33991 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM4P33991 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM4P33991 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM4P33991 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM4P33991 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM4P33991 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM4P33991 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM4P33991 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM4P33991 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM4P33991 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM4P33991 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM4P33991 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM4P33991 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM4P33991 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM4P33991 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM4P33991 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM4P33991 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM4P33991 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM4P33991 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM4P33991 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM4P33991 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM4P33991 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM4P33991 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM4P33991 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM4P33991 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM4P33991 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM4P33991 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM4P33991 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM4P33991 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM4P33991 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM4P33991 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM4P33991 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM4P33991 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM4P33991 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM4P33991 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM4P33991 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM4P33991 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM4P33991 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM4P33991 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM4P33991 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM4P33991 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM4P33991 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM4P33991 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM4P33991 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM4P33991 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM4P33991 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM4P33991 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM4P33991 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM4P33991 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM4P33991 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM4P33991 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms