Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP1P32455 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP1P32455 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP1P32455 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP1P32455 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP1P32455 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP1P32455 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP1P32455 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP1P32455 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP1P32455 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP1P32455 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GBP1P32455 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GBP1P32455 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GBP1P32455 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GBP1P32455 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
GBP1P32455 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP1P32455 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP1P32455 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP1P32455 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP1P32455 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP1P32455 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP1P32455 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP1P32455 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP1P32455 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP1P32455 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP1P32455 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP1P32455 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP1P32455 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP1P32455 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP1P32455 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP1P32455 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP1P32455 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP1P32455 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP1P32455 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP1P32455 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP1P32455 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP1P32455 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP1P32455 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP1P32455 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP1P32455 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP1P32455 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP1P32455 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP1P32455 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP1P32455 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP1P32455 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP1P32455 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP1P32455 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP1P32455 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP1P32455 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP1P32455 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP1P32455 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP1P32455 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP1P32455 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP1P32455 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP1P32455 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP1P32455 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP1P32455 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP1P32455 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP1P32455 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP1P32455 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP1P32455 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP1P32455 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP1P32455 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP1P32455 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP1P32455 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP1P32455 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP1P32455 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP1P32455 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP1P32455 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP1P32455 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP1P32455 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP1P32455 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP1P32455 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP1P32455 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP1P32455 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP1P32455 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP1P32455 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP1P32455 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP1P32455 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP1P32455 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP1P32455 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP1P32455 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP1P32455 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP1P32455 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP1P32455 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP1P32455 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP1P32455 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP1P32455 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GBP1P32455 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP1P32455 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP1P32455 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP1P32455 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP1P32455 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP1P32455 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP1P32455 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP1P32455 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP1P32455 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP1P32455 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP1P32455 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP1P32455 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms