Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRS3P32247 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRS3P32247 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRS3P32247 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRS3P32247 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BRS3P32247 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BRS3P32247 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BRS3P32247 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRS3P32247 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BRS3P32247 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRS3P32247 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRS3P32247 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRS3P32247 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRS3P32247 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRS3P32247 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRS3P32247 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRS3P32247 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRS3P32247 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRS3P32247 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRS3P32247 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRS3P32247 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRS3P32247 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRS3P32247 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRS3P32247 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRS3P32247 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRS3P32247 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRS3P32247 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRS3P32247 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRS3P32247 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRS3P32247 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRS3P32247 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRS3P32247 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRS3P32247 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRS3P32247 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRS3P32247 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRS3P32247 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRS3P32247 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRS3P32247 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRS3P32247 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRS3P32247 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRS3P32247 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRS3P32247 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRS3P32247 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRS3P32247 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRS3P32247 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRS3P32247 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRS3P32247 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRS3P32247 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRS3P32247 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRS3P32247 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRS3P32247 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRS3P32247 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRS3P32247 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRS3P32247 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRS3P32247 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRS3P32247 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRS3P32247 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRS3P32247 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRS3P32247 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRS3P32247 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BRS3P32247 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRS3P32247 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRS3P32247 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRS3P32247 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRS3P32247 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRS3P32247 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BRS3P32247 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRS3P32247 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRS3P32247 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRS3P32247 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRS3P32247 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRS3P32247 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRS3P32247 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRS3P32247 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRS3P32247 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRS3P32247 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRS3P32247 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRS3P32247 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRS3P32247 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRS3P32247 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRS3P32247 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRS3P32247 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRS3P32247 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRS3P32247 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRS3P32247 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRS3P32247 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRS3P32247 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRS3P32247 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRS3P32247 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BRS3P32247 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRS3P32247 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRS3P32247 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRS3P32247 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRS3P32247 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRS3P32247 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRS3P32247 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRS3P32247 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRS3P32247 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRS3P32247 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRS3P32247 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms