Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC8P31273 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms