Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CLIP1P30622 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms