Protein–RNA interactions for Protein: P30613

PKLR, Pyruvate kinase PKLR, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKLRP30613 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKLRP30613 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKLRP30613 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKLRP30613 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKLRP30613 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKLRP30613 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKLRP30613 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKLRP30613 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PKLRP30613 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKLRP30613 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKLRP30613 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKLRP30613 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKLRP30613 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKLRP30613 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKLRP30613 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKLRP30613 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKLRP30613 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKLRP30613 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKLRP30613 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKLRP30613 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKLRP30613 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKLRP30613 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKLRP30613 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKLRP30613 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKLRP30613 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKLRP30613 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKLRP30613 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKLRP30613 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKLRP30613 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PKLRP30613 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKLRP30613 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PKLRP30613 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKLRP30613 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKLRP30613 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PKLRP30613 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKLRP30613 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKLRP30613 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKLRP30613 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKLRP30613 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKLRP30613 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKLRP30613 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKLRP30613 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKLRP30613 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKLRP30613 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKLRP30613 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKLRP30613 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PKLRP30613 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PKLRP30613 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PKLRP30613 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKLRP30613 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKLRP30613 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKLRP30613 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PKLRP30613 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKLRP30613 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKLRP30613 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKLRP30613 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKLRP30613 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PKLRP30613 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKLRP30613 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKLRP30613 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKLRP30613 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKLRP30613 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKLRP30613 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKLRP30613 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKLRP30613 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKLRP30613 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKLRP30613 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKLRP30613 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKLRP30613 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKLRP30613 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKLRP30613 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKLRP30613 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKLRP30613 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKLRP30613 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKLRP30613 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKLRP30613 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKLRP30613 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKLRP30613 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKLRP30613 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKLRP30613 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKLRP30613 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKLRP30613 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKLRP30613 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKLRP30613 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKLRP30613 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKLRP30613 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKLRP30613 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKLRP30613 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKLRP30613 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKLRP30613 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKLRP30613 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKLRP30613 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKLRP30613 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKLRP30613 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKLRP30613 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKLRP30613 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PKLRP30613 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKLRP30613 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKLRP30613 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKLRP30613 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms