Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TM4SF1P30408 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
TM4SF1P30408 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TM4SF1P30408 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms