Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCND2P30279 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCND2P30279 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCND2P30279 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCND2P30279 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCND2P30279 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCND2P30279 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCND2P30279 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCND2P30279 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCND2P30279 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCND2P30279 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCND2P30279 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCND2P30279 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCND2P30279 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCND2P30279 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND2P30279 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND2P30279 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND2P30279 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND2P30279 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND2P30279 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND2P30279 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND2P30279 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND2P30279 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND2P30279 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND2P30279 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND2P30279 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCND2P30279 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCND2P30279 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCND2P30279 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCND2P30279 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCND2P30279 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCND2P30279 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND2P30279 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND2P30279 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND2P30279 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND2P30279 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND2P30279 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND2P30279 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND2P30279 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND2P30279 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND2P30279 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND2P30279 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND2P30279 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND2P30279 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND2P30279 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND2P30279 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND2P30279 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND2P30279 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND2P30279 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND2P30279 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCND2P30279 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCND2P30279 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCND2P30279 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCND2P30279 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCND2P30279 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCND2P30279 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCND2P30279 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCND2P30279 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCND2P30279 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCND2P30279 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCND2P30279 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCND2P30279 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCND2P30279 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCND2P30279 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCND2P30279 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCND2P30279 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCND2P30279 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCND2P30279 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCND2P30279 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCND2P30279 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCND2P30279 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCND2P30279 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCND2P30279 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCND2P30279 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCND2P30279 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCND2P30279 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCND2P30279 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCND2P30279 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCND2P30279 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCND2P30279 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCND2P30279 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCND2P30279 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCND2P30279 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCND2P30279 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCND2P30279 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCND2P30279 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCND2P30279 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCND2P30279 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCND2P30279 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCND2P30279 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCND2P30279 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCND2P30279 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCND2P30279 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCND2P30279 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCND2P30279 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCND2P30279 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCND2P30279 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCND2P30279 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCND2P30279 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCND2P30279 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms