Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC27P30260 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC27P30260 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC27P30260 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC27P30260 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC27P30260 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC27P30260 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC27P30260 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC27P30260 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC27P30260 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC27P30260 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC27P30260 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC27P30260 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC27P30260 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC27P30260 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC27P30260 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC27P30260 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC27P30260 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC27P30260 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC27P30260 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC27P30260 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC27P30260 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC27P30260 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC27P30260 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC27P30260 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC27P30260 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC27P30260 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC27P30260 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC27P30260 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC27P30260 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC27P30260 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC27P30260 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC27P30260 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC27P30260 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC27P30260 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC27P30260 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC27P30260 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC27P30260 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC27P30260 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC27P30260 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC27P30260 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC27P30260 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC27P30260 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDC27P30260 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDC27P30260 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CDC27P30260 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC27P30260 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC27P30260 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC27P30260 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC27P30260 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC27P30260 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC27P30260 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC27P30260 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDC27P30260 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDC27P30260 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDC27P30260 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDC27P30260 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDC27P30260 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDC27P30260 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDC27P30260 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC27P30260 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC27P30260 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC27P30260 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC27P30260 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC27P30260 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC27P30260 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC27P30260 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC27P30260 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC27P30260 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC27P30260 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC27P30260 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC27P30260 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC27P30260 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC27P30260 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC27P30260 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC27P30260 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC27P30260 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC27P30260 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC27P30260 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC27P30260 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC27P30260 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC27P30260 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC27P30260 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC27P30260 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC27P30260 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC27P30260 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC27P30260 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC27P30260 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC27P30260 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC27P30260 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC27P30260 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC27P30260 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC27P30260 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC27P30260 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDC27P30260 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC27P30260 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC27P30260 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC27P30260 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC27P30260 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC27P30260 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms