Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCKSP29966 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms