Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRMP28827 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRMP28827 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
PTPRMP28827 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRMP28827 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
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