Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NMBRP28336 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMBRP28336 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NMBRP28336 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMBRP28336 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NMBRP28336 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NMBRP28336 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NMBRP28336 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NMBRP28336 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NMBRP28336 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NMBRP28336 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NMBRP28336 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMBRP28336 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMBRP28336 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMBRP28336 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMBRP28336 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMBRP28336 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMBRP28336 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMBRP28336 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMBRP28336 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMBRP28336 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMBRP28336 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMBRP28336 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMBRP28336 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMBRP28336 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMBRP28336 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMBRP28336 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMBRP28336 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMBRP28336 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMBRP28336 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMBRP28336 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMBRP28336 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMBRP28336 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMBRP28336 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMBRP28336 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMBRP28336 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMBRP28336 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMBRP28336 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMBRP28336 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMBRP28336 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMBRP28336 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMBRP28336 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMBRP28336 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMBRP28336 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMBRP28336 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMBRP28336 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMBRP28336 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMBRP28336 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMBRP28336 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMBRP28336 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMBRP28336 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NMBRP28336 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NMBRP28336 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NMBRP28336 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NMBRP28336 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMBRP28336 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMBRP28336 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NMBRP28336 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMBRP28336 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMBRP28336 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NMBRP28336 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMBRP28336 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMBRP28336 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMBRP28336 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMBRP28336 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMBRP28336 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMBRP28336 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMBRP28336 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMBRP28336 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMBRP28336 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMBRP28336 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NMBRP28336 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMBRP28336 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMBRP28336 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMBRP28336 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMBRP28336 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMBRP28336 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMBRP28336 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMBRP28336 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMBRP28336 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMBRP28336 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMBRP28336 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMBRP28336 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMBRP28336 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NMBRP28336 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMBRP28336 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMBRP28336 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMBRP28336 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMBRP28336 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMBRP28336 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMBRP28336 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMBRP28336 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMBRP28336 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NMBRP28336 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMBRP28336 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMBRP28336 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMBRP28336 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMBRP28336 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMBRP28336 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMBRP28336 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
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