Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms