Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMA3P25788 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA3P25788 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms